故事发生在战国时代，普通人家出身的男孩猪名寺乱太郎祖辈曾是忍者，在父亲的劝说下，他离开家乡摄津，进入当时一流的忍者学园学习。在学校，他认识了与之同龄的新兵卫和雾丸。新兵卫是一个出身富商家庭的小胖子，为

忍法杀戮合战，再起。　　于庆长之世爆发的三代将军继承人之争，　　演变成为甲贺、伊贺的忍法杀戮合战，达到凄惨之极致。　　在凋零的花瓣当中，为爱而生的男子与女子，　　也梦幻而美丽地消逝——

十多年前一只拥有巨大威力的妖兽“九尾妖狐”袭击了木叶忍者村，当时的第四代火影拼尽全力，以自己的生命为代价将“九尾妖狐”封印在了刚出生的鸣人身上。木叶村终于恢复了平静，但村民们却把鸣人当成像“九尾妖狐”

繁华大都会美国纽约，邪恶领袖施莱德率领的大脚帮在城市内为非作歹，甚嚣尘上安保公司老板埃里克·萨克斯推出最新安保系统，发誓维护城市的和平。第6频道女记者爱普尔·奥尼尔偶然拍到大脚帮被四名神秘侠客挫败的画

布鲁斯 韦恩（克里斯汀?贝尔 Christian Bale 饰）童年亲眼目睹了父母在高谭市街头被歹徒枪杀，韦恩充满怒火。在继承了父亲亿万家产后，韦恩开始环游世界，希望凭自己的力量复仇和打击犯罪！　　韦

孤儿瑞佐从小被一个名叫奥祖奴的神秘集团所收养，并被训练成为一位武功极高的刺客。因为自己的好朋友被奥祖奴集团残忍杀害，原本就已经厌倦杀人生涯的瑞佐，就此下决心脱离集团，随后隐藏起来，等待时机为朋友报仇。

在一个随时都在被人追杀的陌生国度，凯西得到师傅的重托带着传说中的神秘武器来到纽约。师傅最终惨遭杀害，为了替师报仇，也为了解开宝物的真相，凯西开始通过仅有的一点点线索去寻求幕后的黑手。当他一点点拨云见日

　　随着和平的到来而走向近代化的木叶忍者村。高楼林立，巨大显示屏中播放出影像，连结各区域的电车在村里奔驰。虽说是忍者村，但一般民众也增多，忍者的生存方式也在逐渐改变的这个时代——   &

故事以江户时代后期为舞台，最强死刑犯忍者「画眉丸」为了能再次与最爱的妻子见面，与处刑人「山田浅右卫门佐切」一同前往被称为极乐净土的小岛，找寻「不老不死的仙药」以换取无罪释放，并在岛上与神秘的怪物以及其